要开始千来神祠的隐藏密室，首先需要完成前置的解密任务。玩家需传送到千来神祠的传送锚点，进入洞穴后找到藤蔓并攀爬上去，到达指定位置后触摸栖木激活机关，会开始三个羽毛的追踪任务。第壹个羽毛位于栖木附近，第二个羽毛在小坡上且会移动，需跟随获取，第三个羽毛则位于建筑最下层，沿途可顺便完成其他解密。完成羽毛收集后，水位会下降，露出隐藏通道入口。

玩家需运用道具奇妙的羽毛激活雷鸟雕像，观察地面出现的石纹顺序，随后前往标记点按照相同顺序点亮石根文字。解密经过中需注意，千来神祠区域共有七块分散的石板，包括知比山底、菅名山底等位置，需全部收集才能完全解开密室。部分石板需要击败遗迹重机或解开雷元素方碑机关才能获取，提议提前准备战斗人物。

密室内部存在多重机关，包括继电石连接和火把解谜。玩家需按照特定顺序连接继电石装置，成功后会出现宝箱并解开最终机关。火把解谜需在草丛中找到隐藏火把，运用羽毛激活后召唤雷种子穿梭窗户。注意避开巡逻的敌人，合理利用环境物品辅助解谜，部分区域需要风元素人物激活风车机关。

完成全部解密后，玩家将获取珍贵道具、原石奖励以及开始后续隐藏任务的权限。提议携带雷元素人物应对机关挑战，同时运用元素视野寻找隐藏线索。若遇到困难，可参考其他玩家的石板解密策略，但需注意部分机关存在随机性，需灵活调整解谜策略。该密室设计融合了环境观察、战斗和逻辑推理，是寻觅鹤观岛剧情的核心环节其中一个。